De prijs wordt bepaald aan de hand van de bilaterale markt, dus wat er tussen de twee handelende partijen wordt afgesproken. De hoogte van de prijs is onder andere afhankelijk van het type en de locatie van opwekking. Doordat de consument bereid is meer te betalen voor lokale duurzame energie ligt de prijs van een GvO van waterkracht uit Noorwegen bijvoorbeeld een stuk lager dan die vanuit wind of zonne-energie in Nederland.
De handel is niet openbaar, wat voor en nadelen heeft. Voordeel is dat de RVO de opbrengst van een GvO niet kan verrekenen met eventueel verkregen subsidie. Nadeel is dat de producent niet kan controleren wat de prijs is geweest. Het is dus belangrijk dat je vertrouwen hebt in de gekozen handelaar.